肛裂病理组织变化可分为四个阶段：
    初发期：由以上各种因素引起的肛裂，初起肛管皮肤浅表损伤，或呈表浅性溃疡，创口周围组织基本正常。
    溃疡形成期：创口有不良肉芽增生。创底见有环状纤维，创缘皮肤增生。
    慢性溃疡期：创口陈旧性溃疡，刨底可见内括约肌。
    慢性溃疡合并其它病理改变期：在慢性溃疡基础上有潜行性肛瘘等、慢性肛裂常合并以下病理改变。
    ① 肛乳头炎：溃疡上端与齿线相连，炎性扩散，常引起肛窦炎，后形成肛乳头肥大。
    ② 肛窦炎：由肛窦感染扩散，肛管皮下形成小脓肿，破溃生成溃疡。先有肛裂，后引起肛窦炎。
    ③ 梭形溃疡：肛管皮肤裂伤，经过感染，形成溃疡。
    ④ 肛门梳硬结：即栉膜嗜厚和变硬，形成梳状硬结，暴露在溃疡的基底，妨碍括约肌的舒张，影响溃疡的。
    ⑤ 潜性瘘管：肛窦基底常见有瘘管于溃疡相通，是因为肛窦感染化脓，形成小脓肿破溃所致。
    ⑥ 裂痔：裂口下端皮肤因炎症改变，浅部静脉及淋巴回流受阻，引起水肿，组织增生。形成结缔组织性外痔，又称为哨兵痔。