有的肛瘘术后创面经久不愈，脓水不断，有的术后伤口不久又出现肛门肿痛，流脓等症状，常见原因有：
　　①手术时没有找到的内口或处理内口不正确，造成了假内口，即使找到内口、但未清除感染的肛窦、肛腺及其导管。
　　②瘘道尚未形成时而急于手术，易使炎症扩散，形成新的脓腔和窦道。
　　③手术时因瘘管弯曲，术中造成假瘘道或瘘管被残留，或瘦道内的坏死组织搔刮不干净，使病变肠。
　　④瘘管手术后，创口内留有异物，如留有线头或棉花絮，被周围肉芽组织包埋、感染而影响伤口生长。
　　⑤肛瘘切除一期缝合的手术，术中应用全层缝合，勿留间隙和死腔；缝合张力不要太大，缝合要严密，否则使延迟。
　　⑥手术仅切除了主要瘘管，遗留了一部分支瘘管，可造成术后肠。
　　⑦患者体质虚弱或伴有糖尿病、肺结核、白血病、贫血等慢性疾病，也可影响伤口感染与。
　　为防止肛瘘术后不佳或术后肠，术中要清除病灶，以及不利于伤口的因素；术后预防伤口感染，可全身应用抗生素，同时要保持创口引流通畅，保持创口组织增长均匀，肛缘外创口不得过早等。