肛瘘手术后处理十分重要，甚至可以说手术后处理的好坏对手术效果的优劣有直接影响。一般而言，在手术后24小时，便将伤口内的凡士林纱布及其他填充纱布取出，若创面较深较大，则可于48小时后取出，若患者排便，便后要坐浴患处，并换。肛瘘手术后早期每日必须换，可以说肛瘘手术后换的重要性不亚于甚至在某种程度上还要高于肛瘘手术的重要性。因为肛瘘手术后的创面往往是敞开的，通过手术后换，可以达到以下作用：
　　1、去除手术创面的分泌物和粪便，保持创面清洁，防止污染进而引起感染；
　　2、换时置入伤口的物纱条不仅可以通畅引流，还可起到保护创面的作用；
　　3、换时可以使用一些促进创面生长物如贝复济等；
　　4、有利于发现并处理不健康的肉芽组织，促进伤口；
　　5、通过纱条的填充，可伤口从基底开始，避免桥形。