直肠炎也可能是不明原因(如溃疡性直肠炎和克罗恩病)，或者是由性传播疾病［如淋病；梅毒，常是继发的；衣原体结膜炎；单纯性疱疹或巨细胞病毒(CMU)］或由其他感染(如弯曲菌，志贺菌，沙门菌)引起；这可与先前的抗生素应用有关。
    　男性同性恋者更常见。免疫缺陷的患者感染单纯性疱疹和巨细胞病毒的危险性很大。在少数患者中，非特异性直肠炎可进展为慢性溃疡性结肠炎或由克罗恩病累及所致。
　　直肠炎轻者仅粘膜发炎，重者炎症累及粘膜下层、肌层，甚至直肠周围组织；有时只是一部分直肠粘膜受累，有时直肠粘膜全部发炎，也可累及结肠部分粘膜都有炎症。中医认为直肠炎与“湿热内瘟”、“饮食停滞”、“脾胃虚弱”和“虫积湿滞”有关。
　　直肠炎常见于体质虚弱抵抗力低下，心、肺、肝、胃肠道疾病、呼吸道感染、传染病后，大便秘结、腹泻、痔，肛管直肠脱垂，肛瘘、息肉病、肛门直肠狭窄、直肠肿瘤、直肠损伤、异物等，都可使直肠发炎，严重的需立刻医院进行手术治疗。另外一些因素如饮食不慎如过度饮酒、过食刺激性强的食物等，不适当的长期服用泻，肛门内腐蚀性物过多，细菌感染均可引起直肠炎。