肛瘘治疗除外科传统的手术和挂线外，近年来国内学者采用中西医方法和运用高科技的方法治疗，获可喜成果。现简介如下：

(1)捻脱管法是祖国医学的传统治疗之一，成都中医大学曹吉勋等结合现代医学技术而设计“内口闭锁捻脱管法”治疗肛瘘，是中西医结合的新方法。将红升丹用桑皮纸做成大小长短不一的捻。麻醉下先用刮匙从外口适当搔刮瘘管，以内口为中心作1×1.5厘米椭圆形切口，向下清除感染肛窦、肛腺及其导管，用肠线缝合肌层(内括约肌)，再将切口上缘粘膜适当游离下拉，覆盖创面，并用细丝线缝合肛管皮肤，以加强闭合内口，再视瘘管大小、深浅、长短、选择适当的红升丹捻插入管道，外涂金黄。术后全身应用抗生素5—7天，局部便后坐浴，每日换红升丹捻一次，当瘘管脓腐脱净流血水时(一般需要4—6天)，停用捻，让伤口自然。本方法简单、疗程短、高，对肛门功能保护好等优点。

(2)激光治疗适用于低值单纯性肛瘘，麻醉下用球头探针从瘘道外口插入，沿瘘管走行缓缓探至内口引出肛门外，将激光输出功率调至25—30W，从外门沿探针向内门方向逐步有效切开，再降低功率约15W左右，将切开的“V”形创面的感染瘘管壁、腐肉等汽化掉，特别是内口周围的肉芽组织切勿遗漏。并向直肠方向延长汽化约0.2厘米，汽化过程中注意将过厚的炭化层用千分之一新洁尔灭棉球擦去，以将病灶汽化干净为度。对高位瘘可激光结合挂线治疗。

本方法治疗肛瘘具有、视野好、能直接灭菌、手术、创伤小、等优点。

(3)冷冻治疗适用于低位单纯性肛瘘的治疗，是利用-196摄氏度液氮使瘘道发生凝固性坏死。继而脱落，形成新的创而而自愈。麻醉下先用刮匙从外口适当搔刮瘘管，再用探针探入，确定瘘管的方向和走行，拔出探头，选择相似形状的冷冻探头(弯曲程度不同的紫铜管，直径2毫米左右)作接触法冷冻，持续冷冻3分钟，使整个管道成白色冰棒，待自然复温后拔出探头，外涂消炎止痛软，术后坐浴、换。