肛管直肠周围脓肿有2大类：一类与肛腺及肛瘘有关称为原发性急性肛腺肌间瘘管性脓肿，简称瘘管性脓肿较多见；一类与肛腺及肛瘘无关称为急性非肛腺性非瘘管性脓肿，简称非瘘管性脓肿较少见；肛瘘大多由前者发展而来。肛瘘多为一般化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核克罗恩病、溃疡性结肠炎。直肠肛管外伤继发感染也可形成肛瘘，直肠肛管恶性肿瘤也可溃破成瘘管，但都很少见，与一般化脓性肛瘘有明显区别。
　　有人推测性激素的影响是肛瘘发生的主要原因，在青春期人体自身的性激素开始活跃，随即一部分皮脂腺特别是肛腺开始发育，增殖男性较女性增生明显。由于肛腺分泌旺盛，若加上肛腺排泄不畅或肛腺管阻滞，则易感染引起肛腺炎，这可解释男性青壮年为何肛瘘发病率较高，而女性肛腺导管较直不如男性弯曲分泌物不易淤积，所以女性肛瘘发病率较低，人到老年与其他皮脂腺普遍萎缩的同时肛腺也随之萎缩，故老年人肛瘘少见。
　　肛瘘有原发性内口、瘘管支管和继发性外口，内口即感染源的入口，多在肛窦内及其附近后正中线的两侧，多见但也可在直肠下部或肛管的任何部位，瘘管有直有弯。少数有分支外口即脓肿溃破处或切开引流的部位多位于肛管周围皮肤，由于病原菌不断经内口进入管道加之管道迂曲行走于内外括约肌附近管壁，由纤维组织构成管内有肉芽组织故经久不愈。
　　一般单纯性肛瘘只有1个内口和1个外口，这类肛瘘临床上多见若外口暂时封闭，局部引流不畅则又逐渐发生感染再次形成脓肿。封闭的外口可再穿破或在其他处形成另一外口，如此发作使病变范围扩大或有时造成几个外口与内口相通，这种肛瘘称为复杂性肛瘘，即有1个内口与多个外口，但有人认为复杂性肛瘘不应以外口的多少划分，而是指主要瘘管累及肛管直肠环或环以上者，虽然这种肛瘘只有1个外口及1个内口，但治疗比较复杂故称为复杂性肛瘘，相反有时肛瘘虽有多个外口但治疗并不复杂。
        武汉博仕中医肛肠医院温馨提示：肛肠疾病不容忽视，若发现自己得了肛肠疾病，应该到医院及时治疗。